Detecção de SARS-CoV-2 em esgoto de estabelecimento penal e de hospital universitário: protocolos e padronizações das coletas

Carmem Cícera Maria da Silva; Kamily Fagundes Pussi; Eliomar Pivante Céleri; David Salles; Julia Miranda Fardin; Carolina Rangel de Lima Santos; Marcelo dos Santos Barbosa; Thays Ohana dos Santos Romeiro; Rosangela Maria Ferreira da Costa e Silva; Daniel Claudio de Oliveira Gomes; Vinicius de Oliveira Ribeiro; Leila Cristina Konradt Moraes; Herintha Coeto Neitzke Abreu; Valdemar Lacerda Júnior

doi:10.47456/rbps.v25i3.41091

Autores/as

Carmem Cícera Maria da Silva UFES
Kamily Fagundes Pussi
Eliomar Pivante Céleri https://orcid.org/0000-0003-0398-1687
David Salles
Julia Miranda Fardin
Carolina Rangel de Lima Santos https://orcid.org/0000-0003-0607-0870
Marcelo dos Santos Barbosa
Thays Ohana dos Santos Romeiro
Rosangela Maria Ferreira da Costa e Silva https://orcid.org/0000-0002-6792-2558
Daniel Claudio de Oliveira Gomes
Vinicius de Oliveira Ribeiro https://orcid.org/0000-0002-4373-1132
Leila Cristina Konradt Moraes https://orcid.org/0000-0001-7574-8978
Herintha Coeto Neitzke Abreu https://orcid.org/0000-0001-5848-670X
Valdemar Lacerda Júnior Universidade Federal do Espírito Santo https://orcid.org/0000-0002-8257-5443

DOI:

https://doi.org/10.47456/rbps.v25i3.41091

Palabras clave:

Águas residuárias, SARS-CoV-2, Instituição penal, Hospital universitário

Resumen

Introdução: O monitoramento de esgoto como forma de controle da covid-19 é reconhecido mundialmente desde 2020. A confiabilidade dos resultados depende de uma metodologia representativa de todas as variáveis envolvidas no processo. As peculiaridades de cada ambiente de coleta tornam a padronização de procedimentos um processo árduo e não linear. Objetivo: Este relato visa mostrar os desafios e as superações no processo de coleta e armazenamento das amostras de águas residuárias. Métodos: Coleta de amostras de esgoto para análise físico-química e molecular para detecção de SARS-CoV-2 em um estabelecimento penal de regime semiaberto e em um hospital universitário. Relato de experiência: As coletas foram realizadas de forma efetiva e encaminhadas aos laboratórios de Nível de Biossegurança 2 para os procedimentos iniciais de pré-filtração e concentração do SARS-CoV-2. As dificuldades encontradas foram: burocracia na tramitação da liberação para execução do projeto, especificidade das tubulações, diferença na representatividade das amostras, necessidade de rapidez no transporte das amostras, ambientes insalubres nas estruturas físicas dos esgotos avaliados, apresentando riscos físicos e biológicos para a equipe. Conclusão: O aspecto principal do estudo foi a caracterização físico-química e o monitoramento do material genético do SARS-CoV-2, porém, devido às dificuldades encontradas inicialmente, mostrou-se necessária a padronização em futuros projetos de águas residuárias.

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Citas

Kitajima M, Ahmed W, Bibby K, Carducci A, Gerba CP, Hamil¬ton KA, et al. SARS-CoV-2 in wastewater: State of the knowledge and research needs. Sci Total Environ. 2020; 739:139076.

Prado T, Fumian TM, Mannarino CF, Resende PC, Motta FC, Eppinghaus ALF, et al. Wastewater-based epidemiology as a use¬ful tool to track SARS-CoV-2 and support public health policies at municipal level in Brazil. Water Res. 2021; 191:116810.

Li R, Pei S, Chen B, Song Y, Zhang T, Yang W, et al. Substantial undocumented infection facilitates the rapid dissemination of novel coronavirus (SARS-CoV-2). Sci. 2020; 368(6490):489-493.

Desdouits M, Piquet JC, Wacrenier C, Le Mennec C, Parnaudeau S, Jousse S, et al. Can shellfish be used to monitor SARS-CoV-2 in the coastal environment?. Sci Total Environ. 2021; 778:146270.

Albastaki A, Naji M, Lootah R, Almeheiri R, Almulla H, Almarri I, et al. First confirmed detection of SARS-COV-2 in untreated municipal and aircraft wastewater in Dubai, UAE: The use of wastewater based epidemiology as an early warning tool to monitor the prevalence of COVID-19. Sci Total Environ. 2021; 760:143350.

Hemalatha M, Kiran U, Kuncha SK, Kopperi H, Gokulan CG, Mohan SV, et al. Surveillance of SARS-CoV-2 spread using wastewater-based epidemiology: Comprehensive study. Sci Total Environ. 2021; 768:144704.

Cevik M, Tate M, Lloyd O, Maraolo AE, Schafers J, Ho A. SARS-CoV-2, SARS- CoV, and MERS-CoV viral load dynamics, dura¬tion of viral shedding, and infectiousness: a systematic review and meta-analysis. Lancet Microbe. 2021; 2(1):e13-e22.

Xu Y, Li X, Zhu B, Liang H, Fang C, Gong Y, et al. Characteristics of pediatric SARS-CoV-2 infection and potential evidence for persistent fecal viral shedding. Nat Med. 2020; 26(4):502-505.

Weidhaas J, Aanderud ZT, Roper DK, VanDerslice J, Gaddis EB, Ostermiller J, et al. Correlation of SARS-CoV-2 RNA in waste¬water with COVID-19 disease burden in sewersheds. Sci Total Environ. 2021; 775:145790.

De Sousa ARV, Silva LDC, de Curcio JS, Delleon H, Anunciação CE, Furlaneto SMSI, et al. Detecção de SARS-CoV-2 em águas residuárias como ferramenta de predição de infectados de uma capital da região centro-oeste do Brasil. Braz J Infec Dis. 2020; 26:102024.

Alhama J, Maestre JP, Martín MÁ, Michan C. Monitoring COVID-19 through SARS-CoV-2 quantification in wastewater: progress, challenges and prospects. Microbi Biotechnol. 2022; 15(6):1719-1728.

Barreto ML, Barros AJDD, Carvalho MS, Codeço CT, Hallal PRC, Medronho RDA, et al. O que é urgente e necessário para subsidiar as políticas de enfrentamento da pandemia de COVID- 19 no Brasil?. Rev Bras Epidemiol. 2020; 23.

McQuade ETR, Blake IM, Brennhofer SA, Islam MO, Sony SSS, Rahman T, et al. Real-time sewage surveillance for SARS-CoV-2 in Dhaka, Bangladesh versus clinical COVID-19 surveillance: a longitudinal environmental surveillance study (December, 2019–December, 2021). The Lancet Microbe. 2023.

Kasprzyk-Hordern B, Bijlsma L, Castiglioni S, et al. Wastewa¬ter-based epidemiology for public health monitoring. Water and Sewerage Journal. 2014; 4:25-26.

Ahmed W, Bertsch PM, Bivins A, Bibby K, Gathercole A, Har¬amoto E, et a. Comparison of virus concentration methods for the RT-qPCR-based recovery of murine hepatitis virus, a sur¬rogate for SARS-CoV-2 from untreated wastewater. Sci Total Environ. 2020; 739:139960.

Haramoto E, Malla B, Thakali O, Kitajima M. First environ¬mental surveillance for the presence of SARS-CoV-2 RNA in wastewater and river water in Japan. Sci Total Environ. 2020; 737:140405.

Parida VK, Saidulu D, Bhatnagar A, Gupta AK, Afzal MS. A critical assessment of SARS-CoV-2 in aqueous environment: Existence, detection, survival, wastewater-based surveillance, inactivation methods, and effective management of COVID-19. Chemosphere. 2023; 138503.

Leal CD, Espinosa AMF, Araújo JC. Roteiros para análises e determinações em amostras de esgoto. Roteiro 5: Concentração e quantificação do novo coronavírus por técnicas moleculares. Eng Sanit e Ambient. 2022; 2(4):33-40.

Bofill-Mas S, Rusiñol M. Recent trends on methods for the con¬centration of viruses from water samples. Curr Opin Environ Sci Health. 2020; (16):7-13.

Patel M, Chaubey AK, Pittman Jr, CU, Mlsna T, Mohan D. Coro¬navirus (SARS-CoV-2) in the environment: occurrence, per¬sistence, analysis in aquatic systems and possible management. Sci Total Environ. 2021; 765:142698.

Yang Q, Rivailler P, Zhu S, Yan D, Xie N, Tang H, et al. Detec¬tion of multiple viruses potentially infecting humans in sewage water from Xinjiang Uygur Autonomous Region, China. Sci Total Environ. 2021; 754:142322.

Centers for Disease Control and Prevention. Handling Human Waste or Sewage | Water, Sanitation, & Hygiene-related Emer¬gencies & and Outbreaks | Healthy Water | CDC [Internet]. 2022 [cited 2023 May 23]. Available from: https://www.cdc.gov/ healthywater/emergency/sanitation- wastewater/workers_han¬dlingwaste.html.

Kasloff SB, Leung A, Strong JE, Funk D, Cutts T. Stability of SARS-CoV-2 on critical personal protective equipment. Sci Rep. 2021; 11(1):1-7.